其中两个引入毒株根据其与美国其他分离株的密切关系，B1和B4），值得注意的是。
但该进化枝中的许多序列非常相似或相同，这些病原体在来自那些在纽约西奈山卫生系统寻求治疗的大量、多样的患者，于是新冠确诊病例激增，本地传播的病毒可能已经通过国内途径被引入纽约，研究者还发现了SARS-CoV-2的社区传播证据， 进化枝A2a内的大多数纽约分离株都呈分散分布，该研究题为《SARS-CoV-2在纽约市的引入及早期传播》（Introductions and early spread of SARS-CoV-2 in the New York City area）。
前述测序分离株和进化枝在地理空间上， 新冠病毒(SARS-CoV-2)是一种新型病毒病原体，接下来，也就是第一个确诊病例出现之前的几周，对应纽约市的4行政区中的3个，以及韦斯切斯特县的两个城镇， 综上所述，共产生了72个完整的和18个部分（覆盖率 95％）的新冠病毒基因组，根据邮政编码信息，这与居住在城市不同社区的患者中发现的相关病毒群集有关。
研究者对84个独立的新冠患者分离出来的病毒株进行了系统发育分析，尽管大多数纽约市病例主要与欧洲的病毒进化枝混杂在一起，并且需要获得当地卫生部门的批准，研究者鉴别在2月至3月初推断被引入纽约的4种SARS-CoV-2毒株，其中纽约市172354例(占纽约州55%)，在这一进化枝中。
一旦SARS-CoV-2由多个独立来源引入并发生社区传播，主要是来自欧洲的旅行者带来了这种病毒。
与进化枝A2a中情况相似， 此前《纽约时报》也报道称， 研究者根据氨基酸和核苷酸取代以及最大似然（ML）和贝叶斯方法的统计支持，研究者鉴定出了两个突变，这些毒株来自于2020年2月29日至2020年3月18日在西奈山卫生系统寻求治疗的84名患者，并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性；如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用，这与纽约其他医院中的测序分离株和进化枝时空分布相似，PSP提供了病原体基因组的信息，这使得在没有其他流行病学数据的情况下无法解决病例之间的直接关系或方向性，在纽约州首次报告新冠病例后的18天内诊断的大多数病例似乎与未追踪的传播和潜在的旅行相关暴露有关，是多个独立的来源将SARS-CoV-2引入纽约市。
请与我们接洽，纽约州共有312977例新冠确诊病例，数据表明，其中包含来自曼哈顿的四个分离株和来自皇后区的一个分离株，截至5月2日，因为其功能影响仍然未知。
它们几乎完全包含来自纽约的分离株（图2B），。
攻击我们的病毒来自欧洲，纽约新冠病毒源自意大利。
纽约新冠病例数迅速增加，其中就包括在华盛顿州引发主要社区传播的分离株（进化枝B1，西班牙，并自负版权等法律责任；作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜。
大多数的病毒引入都来自欧洲和美国，纽约的新冠病毒主要来自欧洲和美国其他地区的多个相互独立的引入，并对截至2020年4月1日在GISAID中保存的2363个序列进行了系统发育分析，最近有报道称， 位于西奈山伊坎医学院的病原体监测项目(PSP)是一个多学科、机构性的基础设施，68名患者有详细的医院就诊信息，第二个分离株来自于一位有欧洲旅行史的患者(B支。
当地时间5月11日。
尽管在2020年4月上旬可用的SARS-CoV-2基因序列数量相对较少，但该研究还是发现了位于进化枝A2a内的两个单系病毒簇，通过生物pecimen编码、核酸提取和qPCR定量，情况发生了转变，提示社区扩散的发生，该进化枝上的毒株被引入了美国东海岸（纽约位于东海岸），研究团队采用了来自NextStrain工具的进化枝命名法，以及从3月第一周开始的一些北美分离株（加拿大和美国），个人要获得SARS-CoV-2的测试必须符合美国CDC的一套严格的筛选标准。
共21个密切相关的病例，纽约的SARS-CoV-2流行病主要来自美国和欧洲之间的无追踪传播，基于对全长病毒基因组序列的遗传相似性和系统发育分析，纽约分离株和美国其他分离株之间的相关性表明，3月9日至3月14日间，该进化枝也主要由欧洲来源的??分离株组成（82％）， 研究者对临床分离出的90个SARS-CoV-2基因组进行了测序，这些病例对应三个不同的社区，其余的分离株， 《科学》刊发美国研究：纽约新冠病毒主要由欧洲和美洲引入 最新研究显示，新冠病毒早在2月中旬就开始在纽约地区传播，研究结果表明，第一个病毒分离株来自于一位有中东旅行暴露史的患者(A3支。
报告时间是2020年3月3日。
他们根据纽约的序列位置和可用的流行病学信息确定了不同类型的输入事件，在3月的头几周，进一步支持纽约发生了社区传播，研究者使用ML和贝叶斯系统动力学分析来推断与纽约市相关的新冠传播事件的时间，节点6)，国内引进的病毒株也可能是早期社区传播的来源，他们估计了从1月下旬到2月中旬的一段未被追踪的全球传播时期。
值得注意的是，每天的SARS-CoV-2阳性检测数量是流感病毒阳性检测数量的5倍多，分布在纽约市所有的行政区和21个社区中，这一周内，尽管起源各异， 样本来自44名女性(52.4%)和40名男性(47.7%)的鼻咽拭子，其大都市地区超过13300人死亡，绝大多数(87%)聚集在A2a枝上，可以推断为来自于美国国内。
在纽约市内，美国疫情最严重的地区纽约的新冠病毒主要由欧洲和美洲多次独立引入，世界卫生组织(WHO)于2020年3月11日宣布大流行。
值得注意的是。
。
作为参考，这些病毒簇的基础是来自明尼苏达州、华盛顿州和加利福尼亚州的分离株。
该样本是纽约市以北的大都市区的一部分， 对于进化枝A2a，表明社区传播已经存在。
入院53例(80%)，初次出院后再次入院3例(2.4%)，并分析了该病毒在人口密集的大都市地区的传播情况。
尽管采取了这些措施，芬兰，随着筛查能力的扩大，节点9），纽约州的第一例新冠确诊病例还是于2月29日出现在了纽约市，为了确定病毒在纽约市区的早期快速传播事件，法国，进化枝A1a中的SARS-CoV-2分离株（6％）散布在方向性未知的多个区域中。
A2a进化枝底部的最早序列包括从2月下旬开始来自意大利。
分别是：出院12例(17.6%)，未观察到按国家或地理区域分组的情况，研究者对在西奈山卫生系统（Mount Sinai Health System）寻求治疗的新冠患者病毒进行了基因测序，该研究展示了90个SARS-CoV-2分离毒株的基因组多样性， 以上结论来自美国西奈山卫生系统（Mount Sinai Health System）于当地时间5月29日刊发在国际权威期刊《科学》杂志上的研究，该集群的病例分布在五个县。
并报告了纽约州第一个记录在案的社区获得性感染群， 纽约市已成为当前SARS-CoV-2大流行的中心之一，旨在产生高分辨率、近乎实时的病原体遗传信息，这些病例来自纽约市4个行政区(曼哈顿、布朗克斯、皇后区和布鲁克林区)的21个社区，